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High-throughput Method for Detecting Siderophore Production by Rhizosphere Bacteria

Shaohua Gu, Wen Wan, Zhengying Shao, Zhong Wei

2021BIO-PROTOCOL17 citationsDOIOpen Access PDF

Abstract

Siderophores, a key substance that microorganisms produce to obtain iron under iron-limited conditions, play an important role in regulating interactions between beneficial bacteria and pathogenic bacteria. A large number of bacteria were isolated from the rhizosphere, and we used the method presented here to assay the siderophore production by these rhizosphere bacteria. This method is a modified version of the universal chrome azurol S (CAS) assay that uses a 96-channel manual pipetting workstation. By combining the liquid CAS assay with the multi-channel pipette workstation, high-throughput and rapid detection of siderophore production can be achieved. In summary, this method can be used to gain a general understanding of siderophore production by rhizosphere bacteria., [摘要]铁载体, 一种 关键物质即微生物产生以获得铁受限条件下铁, 玩小鬼ortant角色 我Ñ调节相互作用之间有益菌和致病菌。甲升细菌ARGE数从根际分离,并且我们使用这里介绍的方法测定含铁细胞生产由这些根际细菌。此方法是通用的修改版本铬天青S(CAS)测定法,使用96通道手动移液工作站。通过将液体CAS分析与多通道移液器工作站结合使用,可以实现高通量和快速检测铁载体的产生。总之,该方法可以用来获得的一般理解铁载体生产的由根际细菌。[背景]铁载体有三价铁极强的亲和力,是非常重要的 细菌升生存。几乎所有已知的细菌物种可以产生铁载体(Miethke和Marahiel,2007) ,从而影响IR相互作用与微生物在紧密接近。邻近生物产生的铁载体 可以作为促进不可培养 微生物生长的生长因子(Kaeberlein et al。,2002),并且它们在针对某些植物病原体的生物控制机制中也起着重要作用。四十多年前,Kloepper等人。(1980) 最早证明 铁载体的产生是通过数种促进植物生长的荧光假单胞菌菌株(例如A1,BK1,TL3B1和B10)对胡萝卜软腐欧文氏菌进行生物控制的机制的重要性。铁载体在根际微生物组的组成和功能以及植物健康中起着重要作用。所述Ç hrome天青S(CAS)测定,m个用于检测铁载体生成的最常用方法(Schwyn和Neilands,1987年)是基于用于竞争的Fe 3+的染料CAS和的三价铁配合物之间的铁载体。增加对根际细菌生产铁载体的知识 会有所贡献 以一个更好地了解荷兰国际集团的互动小号根际细菌中。高-铁载体生产的通量检测可以通过CAS测定用96通道手动移液工作站组合来实现。在这种方法中,铁载体产量由开发通用化学法的修改版测定Schwyn和Neilands (1987)在2,150代表性细菌的成员,这将有助于以更好地理解 根细菌产生铁载体的能力。

Topics & Concepts

SiderophoreRhizosphereBacteriaPipetteMicroorganismPathogenic bacteriaBiologyChemistryGeneticsPhysical chemistryLegume Nitrogen Fixing SymbiosisPlant-Microbe Interactions and ImmunityGenomics and Phylogenetic Studies
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